经过长期的酝酿和充分的准备，江宁高级中学分校正式开办。2003年5月26日南京市教育局就江宁高级中学《关于举办南京市东山实验中学的请示》作出批复，标志着南京东山实验中学的诞生。批复指出：南京东山实验中学“依托南京市江宁高级中学，财务独立核算，办学经费自筹，师资自聘，按有关教育法规自主招生办学，学校纳入辖区管理，接受市、区教育行政部门的指导、监督和检查”。
　　举办分校是江宁高级中学多年的愿望。关于举办目的，正如《请示》中所说：一是为了进一步实践“三个代表”思想，体现与时俱进的精神，满足广大人民群众对学校教育特别是优质教育日益增长的需要；二是为了扩大名校效应，“做好、做大、做强”重点中学，促进江宁教育布局的调整，带动全区教育的发展；三是为了探索办学机制和模式的转变，保证学校的可持续性发展，适应日趋激烈的科技、教育竞争。近年来南师附中、启东中学等一些名校纷纷向江宁渗透，对江宁高级中学的招生和办学造成很大压力，当然也会激励江宁高中奋发图强、励精图治，努力提升办学水平。从去年就开始的江宁高中的迁址新建以及今年中考招生政策的调整，为江宁高中开办分校提供了机遇。在上级部门的大力支持下，学校抓住机遇，果断决策，实现了江宁高中人多年的夙愿。
　　南京东山实验中学是江宁高中借鉴名校办分校的经验，利用学校自身的品牌和资源，依托本部而开办的国有民营机制的全日制完全中学。2003年招收8个高中班，以后逐步调整、充实，发展为10轨30个班的规模；近两年内积极准备，条件成熟后，开办4―6个初中特色班。依照国务院《社会力量办学条例》和《中华人民共和国民办教育促进法》的有关规定，依法设立学校董事会。董事长由江宁高中校长担任。董事会由董事长、实验中学校长、教职工代表等人员组成。
　　南京东山实验中学与本部完全在教育教学和管理上实行一体化：
　　（1）师资互动，（2）资源共享，（3）课程体系、评估体系一致，（4）选用相同的教材，（5）实施相同的办学理念。学校从校长至教职工均实行聘任制，所有人员均实行“基础工资加绩效工资”的制度，后勤服务将全面实行社会化。实验中学每年向学生收取适当的培养费（标准参照同类学校），并以返还成本的形式逐年上缴本部，用于偿还新校建设的贷款。
　　目前，南京东山实验中学的各项准备工作已经基本完成。学校董事会正式成立，校长人选也已确定。03年招生人数和收费标准均得到上级部门批准。实验中学的开办必将为江宁高中的长远发展注入新的活力。